| EVOBIO2004 PROGRAMME | ||||||||||||||||||||||||||
| 2nd European Workshop on Evolutionary Bioinformatics | ||||||||||||||||||||||||||
| Monday 5 April | ||||||||||||||||||||||||||
| 0830 | Registration desk opens | |||||||||||||||||||||||||
| 0930-1100 | Conference openings and plenary session: invited speaker Stephanie Forrest | |||||||||||||||||||||||||
| 1100-1120 | Coffee break | |||||||||||||||||||||||||
| 1120-1250 | Protein Structure Prediction (chair: Alex Freitas) | |||||||||||||||||||||||||
| A Memetic Algorithm for Protein Structure Prediction in a 3D-Lattice HP Model | ||||||||||||||||||||||||||
| Andrea Bazzoli, Andrea G B Tettamanzi | ||||||||||||||||||||||||||
| Evolving Regular Expression-based Sequence Classifiers for Protein Nuclear Localisation | ||||||||||||||||||||||||||
| Amine Heddad, Markus Brameier, Robert MacCallum | ||||||||||||||||||||||||||
| Two-Step Genetic Programming for Optimization of RNA Common-Structure | ||||||||||||||||||||||||||
| Jin-Wu Nam, Je-Gun Joung, Young-Sirk, Byoung-Tak Zhang | ||||||||||||||||||||||||||
| 1250-1415 | Lunch | |||||||||||||||||||||||||
| 1415-1545 | Genes Interactions and Phylogenetic Search (chair: Carlos Cotta) | |||||||||||||||||||||||||
| An Improved Grammatical Evolution Strategy for Hierarchical Petri Net Modeling | ||||||||||||||||||||||||||
| of Complex Genetic Systems | ||||||||||||||||||||||||||
| Jason Moore, Lance Hahn | ||||||||||||||||||||||||||
| Iteratively Inferring Gene Regulatory Networks with Virtual Knockout Experiments | ||||||||||||||||||||||||||
| Christian Spieth, Felix Streichert, Nora Speer, Andreas Zell | ||||||||||||||||||||||||||
| Discrete Branch Length Representations for Genetic Algorithms in Phylogenetic Search | ||||||||||||||||||||||||||
| Jian Shen, Robert Heckendorn | ||||||||||||||||||||||||||
| 1545-1600 | Coffee break | |||||||||||||||||||||||||
| 1600-1730 | Feature Selection in Microarray and Pattern Proteomic Data (chair: Jason Moore) | |||||||||||||||||||||||||
| Evolutionary Search of Thresholds for Robust Feature Set Selection: Application to the | ||||||||||||||||||||||||||
| Analysis of Microarray Data | ||||||||||||||||||||||||||
| Carlos Cotta, Christian Sloper, Pablo Moscato | ||||||||||||||||||||||||||
| Analysis of Proteomic Pattern Data for Cancer Detection | ||||||||||||||||||||||||||
| Kees Jong, Elena Marchiori, Aad van der Vaart | ||||||||||||||||||||||||||
| 1730-1900 | EuroGP Posters Session | |||||||||||||||||||||||||
| 1930 plus | Conference Reception at Town Hall | |||||||||||||||||||||||||
| Tuesday 6 April | ||||||||||||||||||||||||||
| 0930-1100 | Autonomous Modelling of HIV-immune System Interaction; | |||||||||||||||||||||||||
| Optimal Control of Microbial Systems and of Fermentation Process | ||||||||||||||||||||||||||
| (chair: Elena Marchiori) | ||||||||||||||||||||||||||
| Self-adaptive Scouting---Autonomous Experimentation for Systems Biology | ||||||||||||||||||||||||||
| Naoki Matsumaru, Florian Centler, Klaus-Peter Zauner, Peter Dittrich | ||||||||||||||||||||||||||
| Evolutionary Algorithms for Optimal Control in Fed-batch Fermentation Processes | ||||||||||||||||||||||||||
| Miguel Rocha, José Neves, Isabel Rocha, Eugenio Ferreira | ||||||||||||||||||||||||||
| Constructing Microbial Consortia with Minimal Growth Using a Genetic Algorithm | ||||||||||||||||||||||||||
| Frederik P J Vandecasteele, Thomas F Hess, Ronald L Crawford | ||||||||||||||||||||||||||
| 1100-1120 | Coffee break | |||||||||||||||||||||||||
| 1120-1250 | DNA Sequence Analysis (chair: Dave Corne) | |||||||||||||||||||||||||
| An Improved Genetic Algorithm for the Sequencing by Hybridization Problem | ||||||||||||||||||||||||||
| Carlos A Brizuela, Luis C González, Heidi J Romero | ||||||||||||||||||||||||||
| Multiple Sequence Alignment Using SAGA: Investigating the Effects of Operator Scheduling, | ||||||||||||||||||||||||||
| Population Seeding, and Crossover Operators | ||||||||||||||||||||||||||
| Rene Thomsen, Wouter Boomsma | ||||||||||||||||||||||||||
| 1250-1415 | Lunch | |||||||||||||||||||||||||